המשק החקלאי בכפר הנוער בן שמן הנו משק גדול ומפואר המוחזק כולו ע"י החניכים ורכזי הענפים בלבד.
המשק הנו כלי חינוכי ממדרגה ראשונה שבין יתר תפקידיו: חינוך לערכי החקלאות העבודה ואהבת הארץ, הכשרת החניכים לעבודת צוות ועזרה הדדית, יצירת מנהיגות ואחריות, אהבה לבע"ח לצומח, לאדמה ושמירה על איכות הסביבה.
במשק החקלאי נערכים פרויקטים בענפים השונים כחלק בלתי נפרד מבה"ס וכל החניכים ניגשים ל- 5 יחידות בגרות בחקלאות (חובה). התלמידים ניגשים לבגרות בשתי מגמות ובארבעה ענפים מרכזיים. בעלי חיים: רפת, אורווה
צומח: גן נוי, ירקות וגדולי שדה.
במשק עובדים 285 תלמידים מכתות ח' ועד יב'.
החניכים עובדים במשק מכיתות ח' ועד כיתות י"ב כ- 7 שעות בשבוע.